Lze řezat i molekuly

Mohou být molekuly také řezány? 

S rozvojem a vyspělostí technologie sekvenování nové generace (NGS) se rozsah aplikací v různých tržních oblastech vědeckého výzkumu, diagnostiky a fyzikálního vyšetření neustále rozšiřoval. V dnešní době, s neustálým rozvojem trhu, se rychlost vývoje samotné sekvenační technologie postupně zpomalila a úzká hrdla přípravy vzorků v NGS je stále zřetelnější. Současně jsou neustále vyvíjeny nové metody zaměřené na menší objemy zpracování vzorků, ale fragmentace DNA je vždy nevyhnutelným krokem v procesu výstavby NGS knihovny.

Ultrazvuková fragmentace, založená na hydrodynamickém střihu a ultrazvukové fragmentaci, je nejběžnější metodou fragmentace DNA. Princip je takový: působením vysokofrekvenčních pulzů kapalina generuje nespočet vysokotlakých a nízkotlakých bodů a doprovodné kavitační bubliny existují několik milisekund a prasknou v důsledku změn tlaku. Při tomto procesu se v kapalině vytváří okamžitý vysokopevnostní smyk. síla, která může rozbít buňky, ovlivnit proteiny a řezat DNA. Zde je speciální produkt společnosti Xinzhi Bio: SCIENTZ18-Ultrazvukový nástroj pro přerušení DNA, který využívá bezkontaktní pracovní metodu a dokáže zpracovat až 12 vzorků najednou. Jedná se o imunoprecipitaci chromatinu (Chromatin Immunoprecipitation, ChIP) a standardizovaný nástroj pro platformy výzkumu střihu DNA.